• Главная
  • Кафедра химии природных соединений

Кафедра химии природных соединений

Донцова Ольга Анатольевна

Заведующий кафедрой

д.х.н., академик РАН

E-mail

dontsova@belozersky.msu.ru

Телефон

+7 (495) 932-88-24

Направления научной работы кафедры

 

  • дизайн и синтез новых антибиотиков, основанный на структурном анализе рибосомы;
  • поиск новых антибактериальных веществ путем скрининга библиотек соединений, выяснение их мишеней и механизма действия;
  • биогенез теломеразной РНК человека. Функциональная роль белка hTERP;
  • исследования активации теломеразы для трансляционной медицины;
  • исследование роли клеточных белков в репликации ВИЧ-1;
  • поиск малых открытых рамок считывания и их функции;
  • функционирование систем эксцизионной репарации в ДНК, содержащей G-квадруплексы;
  • дизайн и исследование РНК- и ДНК-аптамеров для тераностики. Разработка биосенсоров с использованием ДНК-аптамеров в качестве узнающих элементов;
  • разработка приложений технологии анализа НК на основе нанопорного секвенирования.

Направления научной работы

 

  • Создание новых типов модифицированных олигонуклеотидов, в том числе несущих нерадиоактивные зонды, антибиотики, стероиды, интеркаляторы, введение химически активных групп в углеводофосфатный остов одно- и двухспиральных нуклеиновых кислот, изучение с их помощью различных аспектов белково-нуклеиновых взаимодействий, молекулярного узнавания и использование их в антисенсовой и сенсовой биотехнологии;
  • Получение олигонуклеотидопептидных конъюгатов, способных проникать в клетку и специфически ингибировать трансляцию мРНК; использование предварительно активированных ДНК- и РНК-дуплексов для зондирования активных центров и центров связывания ферментов нуклеинового обмена, факторов транскрипции человека и трансактивирующих белков ВИЧ-1, а также в качестве белковых "ловушек" и модуляторов генной транскрипции;
  • Исследование ДНК-метилтрансфераз - ферментов, которые метилируют ДНК, внося тем самым эпигенетическую информацию в геном, а нарушения работы которых часто связаны с канцерогенезом; изучение влияния повреждения ДНК канцерогенами, в частности бензо[a]пиреном, и при окислительном стрессе на функционирование ДНК-метилтрансфераз; исследование эндонуклеаз рестрикции, которые широко используются в генетической инженерии для разрезания ДНК;
  • Изучение влияния повреждения ДНК канцерогенами и при окислительном стрессе на функционирование прокариотических и эукариотических ДНК-метилтрансфераз;
  • Исследование транскрипции ДНК-матриц с модифицированными межнуклеотидными группами, изучение механизма инициации транскрипции методом олигонуклеотид-направляемого мутагенеза, получение и исследование серии сигма-субъединиц РНК-полимеразы E. сoli , содержащих аминокислотные замены.

Готтих Марина Борисовна

Заведующий лабораторией

д.х.н., профессор

E-mail

gottikh@belozersky.msu.ru

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-54-07

Список сотрудников лаборатории

Агапкина Юлия Юрьевна

доцент

Email

+7 (495) 939-24-48

agapkina@belozersky.msu.ru

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-54-07

Анисенко Андрей Николаевич

доцент

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-54-07

Буренина Ольга Юрьевна

инженер 1 категории

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-31-48

Долинная Нина Германовна

в.н.с.

Email

+7 (495) 939-24-48

dolinnaya@belozersky.msu.ru

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-54-11

Метелев Валерий Георгиевич

в.н.с.

Email

+7 (495) 939-24-48

metelev@belozersky.msu.ru

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-54-11

Сныга Виктория Геннадьевна

аспирант/техник

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-31-48

Ташлицкий Вадим Неронович

с.н.с.

Email

+7 (495) 939-24-48

tashlitsky@belozersky.msu.ru

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-31-52

Королева Ольга Николаевна

с.н.с.

Email

+7 (495) 939-24-48

koroleva@belozersky.msu.ru

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-31-43

Королев Сергей Павлович

с.н.с., к.х.н.

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-54-07

Никифорова (Абросимова) Людмила Алексеевна

н.с., к.х.н.

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-31-48

Савицкая Виктория Юрьевна

аспирант/техник

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-31-48

Сергеев Александр Вячеславович

н.с., к.х.н.

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-31-44

Кихай Татьяна Федоровна

аспирант/инженер 2 категории

Телефон

+7 (495) 939-24-48

8 (495) 939-54-07

Направления научной работы

 

  • Изучение рибосомы
    • Невозможно переоценить важность рибосомы для функционирования живой клетки. В лаборатории проводится исследование механизмов биосинтеза белка, изучение функциональных ролей компонентов рибосомы, изучение механизмов рибофагии в эукариотических клетках. Для выделения в чистом виде рибосом, несущих летальные мутации, в лаборатории был разработан метод очистки рибосом с использованием аффинного тага, внесенного в рибосомную РНК.
  • Определение функций генов эукариот
    • После открытия двойной спирали ДНК и того, как сохраняется и транслируется генетическая информация, перед учеными всего мира встала задача определения функций генов, установления взаимосвязей между продуктами генов и картирования путей биохимический реакций в живой клетке.
    • В лаборатории было создано несколько десятков линий трансгенных мышей, среди которых животные с инактивированными генами, животные с вставкой чужеродных генов и модели с добавлением пептидного тага в заранее выбранный ген.
  • Изучение теломеразы
    • В человеческом организме теломеразы - единственная молекулярная машина, способная к обратной транскрипции. Она активна в клетках постоянно регенерирующихся тканей, но также нередко активизируется в раковых клетках. Научной группой лаборатории было в частности показано, что теломеразная РНК кодирает белок hTERP, вносящий весомый вклад в защиту клеток от апоптоза. Помимо этого, hTERP принимает участие в модуляции активации аутофагии, оказывая влияние на сигнальный каскад AMPK. В лаборатории была показана возможность создания препаратов, ингибирующих сборку активного комплекса теломеразы.
  • Изучение антибиотиков
    • Проблема роста резистентности бактерий к известными антибиотикам является одной из главных медицинских проблем 21 века, серьезность которой только усугляется с годами. В лаборатории проводится поиск новых соединений с антибиотической активностью - для этого была разработана высокопроизводительная система скрининга веществ, потенциально обладающих антимикробным действием, позволяющая определить мишень действия - бактериальная ДНК или рибосома. Также в лаборатории проводится изучение действия уже известных антибиотиков с целью последующего дизайна новых молекул.
  • Поиск селективных антираковых препаратов
    • Несмотря на развитие противоопухолевой терапии, в настоящее время высокоспецифичные препараты существуют лишь для части опухолевых поражений. В лаборатории проводится скрининг соединений, могущих избирательно подавлять выживаемость опухолевых клеток, и изучаются механизмы их активности в живых системах. Разработан тест на основе сокультур клеток неопухолевой и опухолевой этиологии, позволивший проверить селективность действия тысяч соединений, в результате чего был обнаружен ряд веществ, избирательно действующих против опухолевых клеточных линий различной этиологии. Среди них как улучшенные производные веществ с известными механизмами действия, например, антитубулиновым, так и вещества, с неизвестным пока механизмом действия, основанные на неописанных в противоопухолевых разработках молекулярных каркасах. В лаборатории проводится работа по дальнейшему рациональному дизайну потенциальных противоопухолевых препаратов.
  • Изучение сплайсинга
    • Механизмы сплайсинга играют огромную роль в формировании протеомного разнообразия живой клетки, являясь ключевым механизмом того, как продуктами одного гена может быть широкое разнообразие функциональных молекул. Понимание фундаментальных основ жизни, без которого невозможны прикладные разработки, будет неполным без представления о том, как молекулярные процессы в живой клетке протекают во времени и какова система взаимовлияния структуры мРНК и процесса сплайсинга.
    • В лаборатории изучается кинетика сплайсинга с использованием мечения РНК 5-этинилуридином с последующим высокопроизводительным секвенированием. В ходу исследования удалось установить закономерности между скоростью сплайсинга и характеристиками отдельных интронов. В планах начать аналогичную работу по кинетике полиаденилирования и кинетику созревания некодирующих РНК.
    • В сотрудничестве в с коллегами из Сколтеха было также показано, что регуляция сплайсинга зависит от структуры мРНК, конкретно - от дальних РНК взаимодействий.
  • Развитие методов анализа единичных молекул нуклеиновых кислот для биомедицинских приложений
    • Онко-ассоциированные некодирующие РНК
    • Онкологические заболевания - вторая по численности жертв причина смерти в экономически развитых странах. По мере того как увеличивается продолжительность жизни возрастает риск онкологических заболеваний. Определение развития злокачественной опухоли на ранних стадиях - одно из главных условий успешной терапии. Для этого в лаборатории проводится поиск онко-ассоциированных некодиующих РНК, которые могли бы быть достоверными и органоспецифическими маркерами определения онкологического заболевания.
  • Поиск новых драйверных мутаций и моделей развития канцерогенеза
    • Клетки злокачественных опухолей в процессе развития неоплазии накапливают огромное количество мутаций в геноме. Для определения оптимальной стратегии лечения необходимо знать, какие именно мутации явились драйверными - иными словами, сыграли ключевую роль в трансформации здоровых клеток в опухолевые. В лаборатории выполняется работа по поиску и валидации драйверных мутаций онкогенеза и возможных моделей эволюционного развития паттернов накапливающихся мутаций в опухолевых клетках. Работа проводится как на клеточных линиях, так и в животных моделях in vivo.
  • Изучение функции малых неканонических открытых рамок считывания
    • Малые открытые рамки считывания (ОРС) могут регулировать экспрессию генов in cis, кодировать малые функциональные пептиды, являться источником антигенных пептидов или служить основой для появления новых белков и их доменов в процессе эволюции. С помощью системы геномного редактирования CRISPR/Cas9 проводится отбор ОРС, важных для жизнеспособности клеток человека и для протекания таких важных процессов как аутофагия и эпителиально-мезенхимальный переход.
    • Помимо этого, в лаборатории проводится изучение механизма регуляции трансляции нижележащей основной ОРС за счет малых неканонических ОРС как в нормальных условиях роста клеток, так и в условиях различных стрессов.
    • Малые пептиды, закодированные в неканонических ОРС, могут регулировать активность различных белковых комплексов, встраиваясь в них и меняя их конформацию. Для изучения функций малых пептидов определяется их локализация в клетке и проводится поиск их белков-партнеров.
  • ДНК-оперирующие ферменты и модифицированные гетероциклические основания в природе и синтетической биологии
    • Создание технологий одномолекулярного секвенирования позволило перейти к исследованию физико-химических и биологических свойств природных и синтетических модифицированных азотистых оснований, входящих в состав ДНК, на новом уровне. Данные подходы открывают новые возможности изучения молекулярных механизмов работы ДНК-оперирующих ферментов и расширения "нуклеотидного алфавита" в синтетической биологии для получения аптамеров.
    • Научная группа занимается развитием технологии нанопорового секвенирования и созданием новых приложений использования данного метода, а также исследует механизмы возникновения и функции модификаций ДНК: 6-метиладенина, 5-метилцитозина и его производных. Кроме того, изучается влияние неканонических структур ДНК на различные клеточные и химические процессы. Важное место в исследованиях занимает изучение работы ДНК-оперирующих ферментов: полимераз, хеликаз и ДНК-метилтрансфераз.

Донцова Ольга Анатольевна

Заведующий лабораторией

академик РАН, д.х.н.

E-mail

dontsova@genebee.msu.su

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 9328824

Список сотрудников лаборатории

Айсин Камиль Надирович

инженер 1 категории

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-54-18

Антипова Ольга Михайловна

инженер 1 категории

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-31-49

Гасанов Тимур Надирович

аспирант/инженер 1 категории


+7 (495) 939-24-48


Завьялова Елена Геннадиевна

доцент

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-54-18

Скворцов Дмитрий Александрович

доцент

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-54-18

Копылов Алексей Михайлович

профессор, д.х.н.

Email

+7 (495) 939-24-48

kopylov@belozersky.msu.ru

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-31-49

Родин Владимир Алексеевич

аспирант/инженер


+7 (495) 939-24-48


Свеженцева Галина Анатольевна

инженер 1 категории

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-31-44

Зверева Мария Эмильевна

профессор

Email

+7 (495) 939-24-48

mzvereva@chem.msu.ru

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-43-33

Рубцова Мария Петровна

профессор

Email

+7 (495) 939-24-48

mrubtsova@genebee.msu.ru

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-54-18

Лукьянов Дмитрий Александрович

с.н.с.

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-54-18

Зотова Полина Александровна

аспирант/техник

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-54-18

Сергиев Петр Владимирович

профессор

Email

+7 (495) 939-24-48

petya@belozersky.msu.ru

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-54-18

Направления научной работы

 

  • Получение, структурно функциональное исследование и разработка методов использования в медицинских целях протеолитических ферментов;
  • Изучение структуры, функций и путей регуляции пирофосфатаз.


Заведующий лабораторией

Телефон

+7 (495) 939-24-48


Список сотрудников лаборатории

Величко Татьяна Ивановна

н.с., к.х.н.

E-mail

tvel@genebee.msu.ru

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-31-44

Громова Елизавета Сергеевна

в.н.с., д.х.н.

E-mail

gromova@belozersky.msu.ru

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-31-44

Сумбатян Наталия Владимировна

с.н.с, к.х.н.

E-mail

sumbtyan@belozersky.msu.ru

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-55-20

Терещенкова Валерия Феликсовна


Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-55-29

Марьясина Софья Семеновна

н.с.

E-mail

mariasinass@my.msu.ru

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-54-18

Готманова Наталия Николаевна

инженер 1 категории

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-55-29

Бачева Анна Владимировна

доцент

E-mail

anbach@belozersky.msu.ru

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-55-29

Родина Елена Валерьевна

доцент

E-mail

rodina@belozersky.msu.ru

Телефон

+7 (495) 939-24-48

+7 (495) 939-55-41